Досрочное погашение недоимки по решению о проверке не избавит от начисления пеней

ФНС прояснила правомерность такого начисления.

Налоговики напомнили сроки вступления в силу решений о доначислении налогов по результатам проверки:

• в случае согласия с ее результатами — по истечении одного месяца с момента вручения решения;
• в случае несогласия и обжалования — со дня принятия вышестоящим налоговым органом решения по апелляционной жалобе.

Только после этого на ЕНС будет сформирована и учтена совокупная обязанность (п. 9 ст. 101 и ст. 101.2 НК РФ).

Однако налогоплательщик может целиком или частично погасить доначисленные налоги до сроков вступления в силу решений по проверкам. Для этого подают заявление о зачете положительного сальдо. Тогда доначисления учтут в совокупной обязанности последовательно, начиная с самой ранней задолженности в сумме, не превышающей положительное сальдо ЕНС. Но пени  тем не менее начислят, даже с учетом уплаты недоимки до вступления в силу решения о результатах проверки.

Дело в том, что и пени и недоимка учитываются в совокупной обязанности одновременно. Поэтому подача заявления о зачете автоматически влечет за собой учет пеней по соответствующей обязанности.

Таким образом, ФНС не видит в таком механизме противоречий Налоговому кодексу РФ. Получается, что пени начисляют даже при уплате недоимки до вступления в силу решения.